Index A | B | C | D | E | F | G | H | I | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | W | Z A AboutDialog (class in orgui.app.orGUI) addFitParameter() (orgui.datautils.xrayutils.CTRcalc.SXRDCrystal method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.EpitaxyInterface method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.Film method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.PoissonSurface method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) addRelParameter() (orgui.datautils.xrayutils.CTRcalc.SXRDCrystal method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.EpitaxyInterface method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.Film method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.PoissonSurface method) addWeightParameter() (orgui.datautils.xrayutils.CTRcalc.SXRDCrystal method) addWyckoffParameter() (orgui.datautils.xrayutils.CTRcalc.SXRDCrystal method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) addWyckoffParameters() (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) addWyckoffShift() (orgui.datautils.xrayutils.CTRcalc.SXRDCrystal method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) addWyckoffShifts() (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) affine_layer_transform() (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) apply_stacking() (orgui.datautils.xrayutils.CTRcalc.SXRDCrystal method) atom_wyckoff_metadata() (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) autoAddCalculatedBraggReflections() (orgui.app.orGUI.orGUI method) autoFindBraggReference() (orgui.app.orGUI.orGUI method) auxillary_counters (orgui.backend.scans.Scan property) axisToImageNo() (orgui.app.orGUI.orGUI method) B bkgkeys() (orgui.app.orGUI.orGUI method) C calcBraggRefl() (orgui.app.orGUI.orGUI method) calculateAvailableCTR() (orgui.app.orGUI.orGUI method) checkOrUncheckAll() (orgui.app.orGUI.QPlotDeleteWindow method) closeEvent() (orgui.app.orGUI.orGUI method) createLayers() (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.PoissonSurface method) D deleteClicked() (orgui.app.orGUI.QPlotDeleteWindow method) E EpitaxyInterface (class in orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm) exception_hook() (orgui.app.orGUI.UncaughtHook method) F F() (orgui.datautils.xrayutils.CTRcalc.SXRDCrystal method) F_bulk() (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) F_surf() (orgui.datautils.xrayutils.CTRcalc.SXRDCrystal method) F_uc() (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.EpitaxyInterface method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.Film method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.PoissonSurface method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) F_uc_bulk() (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) F_uc_bulk_direct() (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) Film (class in orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm) fromFile() (orgui.datautils.xrayutils.CTRcalc.SXRDCrystal static method) G get_Bragg_rocking_coordinates() (orgui.app.orGUI.orGUI method) get_detector_mask() (orgui.app.orGUI.orGUI method) get_raw_img() (orgui.backend.scans.Scan method) (orgui.backend.scans.SimulationScan method) get_rocking_coordinates() (orgui.app.orGUI.orGUI method) getMuOm() (orgui.app.orGUI.orGUI method) getProfilePlot() (orgui.app.orGUI.Plot2DHKL method) getProfileToolbar() (orgui.app.orGUI.Plot2DHKL method) getProfileWindow() (orgui.app.orGUI.Plot2DHKL method) getReflectionFitData() (orgui.app.orGUI.orGUI method) getReflections() (orgui.app.orGUI.orGUI method) getROIloc() (orgui.app.orGUI.orGUI method) getStaticROIparams() (orgui.app.orGUI.orGUI method) H hideClicked() (orgui.app.orGUI.QPlotDeleteWindow method) I imageNoToAxis() (orgui.app.orGUI.orGUI method) imageNoToOmega() (orgui.app.orGUI.orGUI method) intbkgkeys_rocking() (orgui.app.orGUI.orGUI method) integrateROI() (orgui.app.orGUI.orGUI method) intkey() (orgui.app.orGUI.orGUI method) intkeys_rocking() (orgui.app.orGUI.orGUI method) isValidImageNo() (orgui.app.orGUI.orGUI method) K keyPressEvent() (orgui.app.orGUI.Plot2DHKL method) L layer_behavior (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell property) layer_cycle (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell property) layer_state (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.EpitaxyInterface property) (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell property) layers (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.EpitaxyInterface property) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.Film property) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.PoissonSurface property) loadAll() (orgui.app.orGUI.orGUI method) M main() (in module orgui.app.orGUI) mean_height_absolute (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.PoissonSurface property) module orgui.app.orGUI orgui.backend.scans orgui.main N names (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell attribute) newXyHKLConverter() (orgui.app.orGUI.orGUI method) O omegaToImageNo() (orgui.app.orGUI.orGUI method) onScanAxisChanged() (orgui.app.orGUI.QImportScanCreator method) (orgui.app.orGUI.QScanCreator method) onSearchHKLforStaticROI() (orgui.app.orGUI.orGUI method) onShowBragg() (orgui.app.orGUI.orGUI method) onShowCTRreflections() (orgui.app.orGUI.orGUI method) onShowInterpolatedBg() (orgui.app.orGUI.orGUI method) onShowROI() (orgui.app.orGUI.orGUI method) onViewCalculatedReflection() (orgui.app.orGUI.orGUI method) orGUI (class in orgui.app.orGUI) orgui.app.orGUI module orgui.backend.scans module orgui.main module P parameterStr() (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) Plot2DHKL (class in orgui.app.orGUI) plotImage() (orgui.app.orGUI.orGUI method) plotROI() (orgui.app.orGUI.orGUI method) PoissonSurface (class in orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm) positive_int() (in module orgui.main) Q QDiffractometerImageDialog (class in orgui.app.orGUI) QImportScanCreator (class in orgui.app.orGUI) QPlotDeleteWindow (class in orgui.app.orGUI) QScanCreator (class in orgui.app.orGUI) R rocking_Bragg_extraction() (orgui.app.orGUI.orGUI method) rocking_extraction() (orgui.app.orGUI.orGUI method) rocking_integrate() (orgui.app.orGUI.orGUI method) rocking_static_extraction() (orgui.app.orGUI.orGUI method) S saveBraggRefl() (orgui.app.orGUI.orGUI method) Scan (class in orgui.backend.scans) searchPixelCoordHKL() (orgui.app.orGUI.orGUI method) set_below() (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.EpitaxyInterface method) set_orgui() (orgui.app.orGUI.UncaughtHook method) setDomain() (orgui.datautils.xrayutils.CTRcalc.SXRDCrystal method) setEnergy() (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.EpitaxyInterface method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.Film method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.PoissonSurface method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) setGlobalReferenceUnitCell() (orgui.datautils.xrayutils.CTRcalc.SXRDCrystal method) setLimits() (orgui.datautils.xrayutils.CTRcalc.SXRDCrystal method) setReferenceUnitCell() (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.EpitaxyInterface method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.Film method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.PoissonSurface method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) setXyHKLconverter() (orgui.app.orGUI.Plot2DHKL method) SimulationScan (class in orgui.backend.scans) SQRT2pi (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell attribute) stack_on() (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) stacking_height_absolute (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.EpitaxyInterface property) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.PoissonSurface property) (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell property) stacking_loc_absolute (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.EpitaxyInterface property) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.PoissonSurface property) (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell property) supercell() (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) SXRDCrystal (class in orgui.datautils.xrayutils.CTRcalc) T toFile() (orgui.datautils.xrayutils.CTRcalc.SXRDCrystal method) toStr() (orgui.datautils.xrayutils.CTRcalc.SXRDCrystal method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.EpitaxyInterface method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.Film method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.PoissonSurface method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) translate_layered() (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) U uc_area (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.EpitaxyInterface property) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.Film property) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.PoissonSurface property) UncaughtHook (class in orgui.app.orGUI) UnitCell (class in orgui.datautils.xrayutils.CTRuc) updateFromParameters() (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.EpitaxyInterface method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.Film method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRfilm.PoissonSurface method) (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) updatePlotItems() (orgui.app.orGUI.orGUI method) updateReflections() (orgui.app.orGUI.orGUI method) updateROI() (orgui.app.orGUI.orGUI method) W writable_file() (in module orgui.main) wyckoff_couplings() (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) wyckoff_site_couplings() (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) wyckoff_sites() (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method) Z zDensity_G() (orgui.datautils.xrayutils.CTRuc.UnitCell method)